◆ 肽段水平：氨基酸序列、组成、修饰分析、N/C端序列分析、N-糖位点/O糖位点分析、二硫键、肽图/肽谱图等；

◆ 蛋白水平：完整分子量、脱糖分子量；

◆ 亚基水平：还原分子量、脱糖还原分子量；

◆ 高 级结构：紫外光谱、荧光光谱、拉曼光谱、热稳定性、圆二色性；

◆ 理化性质研究：蛋白质含量（消光系数研究）、氨基酸组成分析、糖化蛋白、唾液酸含量、糖型（N糖苷/O糖苷）、游离巯基含量、大小异质体、电荷异质体等；